Byonic är namnet på ett mjukvarupaket för peptid-och proteinidentifiering med tandem masspektrometri. Denna programvara, som nyligen har blivit kommersiellt tillgänglig, underlättar ett mycket bredare utbud av sökmöjligheter än tidigare sökprogramvara som SEQUEST och Mascot. Byonic tillåter användaren att definiera ett väsentligen obegränsat antal variabla modifieringstyper. Byonic tillåter också användaren att ställa in en separat gräns för antalet förekomster av varje modifieringstyp, så att en sökning kan överväga endast en eller två chans modifieringar såsom oxidationer och deamidationer per peptid, men ändå tillåta tre eller fyra biologiska modifieringar såsom fosforyleringar, som tenderar att kluster ihop. Därför kan Byonic söka efter tiotals eller till och med hundratals modifieringstyper samtidigt utan en oöverkomligt stor kombinatorisk explosion. Byonics Jokerteckensökning tillåter användaren att söka efter oförutsedda eller till och med okända ändringar tillsammans med kända modifieringar. Slutligen tillåter Byons Glykopeptidsökning användaren att identifiera glykopeptider utan förkunskaper om glykanmassor eller glykosyleringsställen. Curr. Protokoll. Bioinform. 40:13.20.1‐13.20.14. 2012 av John Wiley & Sons, Inc.

Lämna ett svar

Din e-postadress kommer inte publiceras.