Byonic este numele unui pachet software pentru identificarea peptidelor și proteinelor prin spectrometrie de masă tandem. Acest software, care a devenit recent disponibil comercial, facilitează o gamă mult mai largă de posibilități de căutare decât software-ul de căutare anterior, cum ar fi SEQUEST și Mascot. Byonic permite utilizatorului să definească un număr esențial nelimitat de tipuri de modificări variabile. Byonic permite, de asemenea, utilizatorului să stabilească o limită separată a numărului de apariții ale fiecărui tip de modificare, astfel încât o căutare să poată lua în considerare doar una sau două modificări întâmplătoare, cum ar fi oxidările și deamidările pe peptidă, dar să permită trei sau patru modificări biologice, cum ar fi fosforilările, care tind să se grupeze împreună. Prin urmare, Byonic poate căuta zeci sau chiar sute de tipuri de modificări simultan fără o explozie combinatorie prohibitiv de mare. Căutare Wildcard Byonic permite utilizatorului să caute modificări neprevăzute sau chiar necunoscute alături de modificările cunoscute. În cele din urmă, căutarea glicopeptidelor Byonic permite utilizatorului să identifice glicopeptidele fără cunoașterea prealabilă a maselor de glican sau a locurilor de glicozilare. Curr. Protocolul. Bioinformă. 40:13.20.1‐13.20.14. 2012 de John Wiley & Sons, Inc.

Lasă un răspuns

Adresa ta de email nu va fi publicată.