Byonic is the name of a software package for peptide and protein identification by tandem mass spectrometry. Deze software, die pas sinds kort in de handel verkrijgbaar is, maakt een veel breder scala aan zoekmogelijkheden mogelijk dan eerdere zoekprogramma ‘ s zoals SEQUEST en Mascot. Byonic stelt de gebruiker in staat om een in wezen onbeperkt aantal variabele modificatietypen te definiëren. Byonic staat ook de gebruiker toe om een afzonderlijke grens op het aantal gebeurtenissen van elk wijzigingstype te plaatsen, zodat een onderzoek slechts één of twee kanswijzigingen zoals oxidaties en deamidations per peptide kan overwegen, Nog drie of vier biologische wijzigingen zoals phosphorylations toestaan, die neigen om samen te cluster. Vandaar dat Byonic kan zoeken naar tientallen of zelfs honderden modificatietypes tegelijk zonder een prohibitief grote combinatorische explosie. Byonic ‘ s Wildcard zoeken kan de gebruiker zoeken naar onverwachte of zelfs onbekende wijzigingen naast bekende wijzigingen. Tot slot, Byonic ’s Glycopeptide Search staat de gebruiker toe om glycopeptiden te identificeren zonder voorafgaande kennis van glycaanmassa’ s of glycosylatieplaatsen. Curr. Protocol. Bioinform. 40:13.20.1‐13.20.14. © 2012 door John Wiley & Sons, Inc.

Geef een antwoord

Het e-mailadres wordt niet gepubliceerd.