a Byonic egy szoftvercsomag neve a peptid és fehérje azonosításához tandem tömegspektrometriával. Ez a szoftver, amely csak a közelmúltban vált kereskedelmi forgalomba, megkönnyíti a keresési lehetőségek sokkal szélesebb körét, mint a korábbi keresési szoftverek, például a SEQUEST és a Mascot. A Byonic lehetővé teszi a felhasználó számára, hogy lényegében korlátlan számú változó módosítási típust definiáljon. A Byonic lehetővé teszi a felhasználó számára, hogy külön korlátot állítson be az egyes módosítási típusok előfordulásainak számára, így a keresés csak egy vagy két véletlenszerű módosítást vehet figyelembe, például oxidációkat és deamidációkat peptidenként, mégis három vagy négy biológiai módosítást engedélyez, például foszforilációkat, amelyek hajlamosak csoportosulni. Ezért a Byonic több tíz vagy akár több száz módosítási típust kereshet egyszerre, megfizethetetlenül nagy kombinatorikus robbanás nélkül. A Byonic helyettesítő karakteres keresése lehetővé teszi a felhasználó számára, hogy váratlan vagy akár ismeretlen módosításokat keressen az ismert módosítások mellett. Végül a Byonic glikopeptid-keresése lehetővé teszi a felhasználó számára a glikopeptidek azonosítását a glikopeptidek vagy glikozilezési helyek előzetes ismerete nélkül. Curr. Protokoll. Bioinformáció. 40:13.20.1‐13.20.14. 6012 szerző: John Wiley & Sons, Inc.

Vélemény, hozzászólás?

Az e-mail-címet nem tesszük közzé.