Byonic est le nom d’un progiciel d’identification des peptides et des protéines par spectrométrie de masse en tandem. Ce logiciel, qui n’est que récemment disponible dans le commerce, facilite un éventail de possibilités de recherche beaucoup plus large que les logiciels de recherche précédents tels que SEQUEST et Mascot. Byonic permet à l’utilisateur de définir un nombre essentiellement illimité de types de modifications variables. Byonic permet également à l’utilisateur de fixer une limite distincte sur le nombre d’occurrences de chaque type de modification, de sorte qu’une recherche ne peut considérer qu’une ou deux modifications fortuites telles que des oxydations et des désamidations par peptide, tout en permettant trois ou quatre modifications biologiques telles que des phosphorylations, qui ont tendance à se regrouper. Par conséquent, Byonic peut rechercher simultanément des dizaines, voire des centaines de types de modifications sans explosion combinatoire prohibitive. La recherche par caractères génériques de Byonic permet à l’utilisateur de rechercher des modifications imprévues ou même inconnues à côté de modifications connues. Enfin, la recherche de Glycopeptides de Byonic permet à l’utilisateur d’identifier les glycopeptides sans connaissance préalable des masses de glycanes ou des sites de glycosylation. Curr. Protoc. Bioinform. 40:13.20.1‐13.20.14. © 2012 par John Wiley & Fils, Inc.

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