Byonic on nimi ohjelmistopaketille peptidin ja proteiinin tunnistamiseksi tandem-massaspektrometrialla. Tämä ohjelmisto, joka on vasta äskettäin tullut kaupallisesti saataville, helpottaa huomattavasti laajempaa hakumahdollisuuksien valikoimaa kuin aiemmat hakuohjelmat, kuten SEQUEST ja Mascot. Byonicin avulla käyttäjä voi määritellä olennaisesti rajattoman määrän muuttujan muunnostyyppejä. Byonicin avulla käyttäjä voi myös asettaa erillisen rajan kunkin muunnostyypin esiintymien lukumäärälle, jolloin haku voi tarkastella vain yhtä tai kahta sattumanvaraista muunnosta, kuten hapettumista ja deamidaatiota peptidiä kohti, mutta sallia kuitenkin kolme tai neljä biologista muunnosta, kuten fosforylaatiota, jotka pyrkivät ryhmittymään yhteen. Näin ollen Byonic voi etsiä kymmeniä tai jopa satoja muunnostyyppejä samanaikaisesti ilman kohtuuttoman suurta kombinatorista räjähdystä. Byonicin Yleismerkkihaun avulla käyttäjä voi etsiä ennakoimattomia tai jopa tuntemattomia modifikaatioita tunnettujen modifikaatioiden ohella. Lopuksi byonicin Glykopeptidihaun avulla käyttäjä voi tunnistaa glykopeptidit ilman ennakkotietoa glykaanimassoista tai glykosylaatiopaikoista. Kurr. Protokolla. Bioinformia. 40:13.20.1‐13.20.14. © 2012 John Wiley & Sons, Inc.

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista.